Periodo: febbraio - dicembre 2026
Corsi di laurea interessati: lauree magistrali in ambito biologico
Referente: Dott. Tiziana Cervelli (IFC-CNR) e Prof.ssa Federica Gemignani (UNIPI)
Sede: Consiglio Nazionale delle Ricerche (CNR), Istituto di Fisiologia Clinica (IFC), Pisa
Descrizione: Obiettivo della tesi è indagare il ruolo delle mutazioni puntiformi dei geni BRCA1/2, identificate nella linea germinale di pazienti pediatrici affetti da diverse tipologie tumorali, per comprenderne il contributo all’insorgenza e alla progressione della malattia.
L’attività sperimentale sarà incentrata sulla caratterizzazione funzionale di queste varianti genetiche mediante saggi in lievito Saccharomyces cerevisiae, un modello sperimentale potente e versatile. Il lavoro di tesi offrirà l’opportunità di acquisire competenze pratiche in numerose tecniche di laboratorio, tra cui la manipolazione di colture di lievito, tecniche di biologia molecolare (clonaggio, mutagenesi sito-specifica, PCR, Western blot) e microscopia a fluorescenza.
Il progetto di tesi si inserisce in una collaborazione attiva con l’Ospedale Pediatrico Bambino Gesù di Roma e fa parte di un più ampio programma di ricerca volto alla valutazione funzionale delle varianti genetiche, con potenziali ricadute rilevanti in ambito di medicina di precisione e oncologia pediatrica.
Contatti: Dott. Tiziana Cervelli (Questo indirizzo email è protetto dagli spambots. E' necessario abilitare JavaScript per vederlo.), Via Giuseppe Moruzzi, 1, 56124 – Pisa, 0503152781

Period: from february 2026
Bacteriophage-Based Strategies for Controlling Major Bacterial Diseases of Rice and Tomato
Introduction: Bacterial diseases significantly limit global rice and tomato production, especially in regions where chemical treatments are costly, ineffective, or environmentally unsustainable. This projects aim to develop bacteriophage-based solutions by combining advanced structural and molecular studies with applied plant pathology. The work builds on our recent discovery of two jumbo bacteriophages active against Dickeya zeae or towards isolating and deploying phages against other high-impact crop pathogens, particularly those relevant to African agriculture.
Supervision and Collaborative Framework: The projects will be supervised in collaboration with Dr. Vittorio Venturi (ICGEB, Trieste, Italy; UM6P, Morocco) and Dr. Mariagrazia Di Luca (ICGEB, Trieste. Italy; University of Pisa, Italy), ensuring strong integration of expertise in plant pathology, microbial ecology, and bacteriophage biology. Structural studies will continue in collaboration with Dr. Luigi De Colibus (CNR Basovizza; University of Oxford, UK).
Project 1: Structural and Functional Characterization of Newly Isolated Jumbo Phages Infecting Dickeya zeae
A previous Masters student isolated and sequenced two novel jumbo bacteriophages with strong lytic activity against Dickeya zeae, the causal agent of rice foot rot disease. These phages, with unusually large genomes and complex virion architecture, represent an ideal system for exploring jumbo phage biology. Cryo-EM studies with Dr. De Colibus are currently underway.
Future investigations on this project will focus on: Host recognition and entry mechanisms, such as adsorption determinants and putative depolymerases; Early infection dynamics, using transcriptomics to reveal how jumbo phages take over Dickeya cellular processes; Phage–host co-evolution and receptor identification, supporting prediction of resistance pathways; Environmental stability and formulation potential, testing phage activity under field-relevant temperature, UV, and humidity conditions;
Project 2: Isolation and Evaluation of Bacteriophages Against Key Rice and Tomato Pathogens of Agricultural Importance
This project will isolate and characterize bacteriophages targeting major bacterial pathogens affecting African and Mediterranean agriculture.
For rice, priority targets include: Pseudomonas fuscovaginae, causal agent of sheath brown rot, widespread in East and Central Africa; Additional seed-borne or water-associated pathogens.
For tomato, the project will address diseases of major concern in North Africa (e.g., Morocco) such as: Soft rot and vascular diseases caused by Pectobacterium and Dickeya spp; Other relevant Gram-negative phytopathogens.

The student will isolate phages, assess lytic activity and host ranges, analyze genomic safety, and design potential phage cocktails. Greenhouse experiments will evaluate biocontrol performance, phage persistence on plant surfaces, and compatibility with integrated pest management strategies.
Scientific and Societal Impact of Both Projects
Both projects will advance fundamental knowledge of bacteriophage biology while generating applied solutions for controlling major bacterial diseases of rice and tomato. Given the emphasis on pathogens affecting African food systems, the research directly supports global goals in sustainable agriculture, reduced pesticide use, and climate-resilient crop protection. The outcomes may pave the way for scalable, low-cost phage-based biocontrol products for smallholder and commercial farming.

Periodo: SEMPRE DISPONIBILE
Corsi di laurea interessati: Lauree magistrali di ambito biologico
Referente: Dott.ssa Silvia Del Ry (Questo indirizzo email è protetto dagli spambots. E' necessario abilitare JavaScript per vederlo.) e Prof.ssa Federica Gemignani (Questo indirizzo email è protetto dagli spambots. E' necessario abilitare JavaScript per vederlo.) 
Sede: Laboratorio di Biochimica e Biologia Molecolare dell’Istituto di Fisiologia Clinica del CNR di Pisa
Descrizione: Il Laboratorio di Biochimica e Biologia Molecolare studia da anni biomarcatori innovativi per la diagnosi e prognosi di patologie cardiovascolari e cardio-metaboliche. La ricerca combina analisi in vivo (campioni plasmatici, tessutali ed esosomi umani e animali) e in vitro (modelli cellulari 2D/organoidi). Per ogni marcatore vengono valutati espressione, produzione, rilascio e meccanismo d’azione, utilizzando metodiche immunometriche, Real-Time PCR e Droplet Digital PCR, con particolare attenzione a mRNA, miRNA e lncRNA implicati nei processi patologici. L’obiettivo è favorire la diagnosi precoce, il trattamento tempestivo e la prevenzione delle malattie cardio-metaboliche.
Attualmente sono disponibili uno/due posti di tirocinio di tesi da attivare nell’immediato nell’ambito del progetto “Individuazione di geni regolatori fondamentali nei bambini e negli adolescenti affetti da diabete mellito di tipo 1 (DMT1) e riconoscimento di una firma biomolecolare per la precoce identificazione del diabete preclinico nei loro fratelli”. Il progetto prevede l’individuazione di molecole circolanti (espressione di RNA codificanti e non codificanti: miRNA, long non-coding RNA) in grado di caratterizzare con maggiore precisione la fase autoimmune del DMT1. Si propone inoltre di individuare biomarcatori circolanti in grado di predire, in fase preclinica e in età evolutiva, l’interessamento cardiovascolare causato dal DMT1, oltre a definire un pannello di biomarcatori circolanti in grado di riconoscere molto precocemente soggetti ad alto rischio di sviluppare DMT1 tra i fratelli di bambini e adolescenti con DMT1 conclamato.
Il tirocinio offre di partecipare attivamente a progetti di ricerca traslazionale; contribuire a pubblicazioni scientifiche; acquisire competenze avanzate in tecniche di biologia molecolare e medicina traslazionale.
Attività di laboratorio: tecniche di biologia molecolare (estrazione di acidi nucleici e proteine, Real-Time PCR e Droplet Digital PCR)
Saggi immunometrici (saggi ELISA o mediante piattaforma MagPix)
Contatti: Dott.ssa Silvia Del Ry Istituto di Fisiologia Clinica- CNR di Pisa - Via Giuseppe Moruzzi, 1, 56124 – Pisa, 0503152793

Periodo: Ottobre-giugno 2026
Corsi di Laurea interessati: tutte le lauree magistrali
Referenti: Dott. Francesco Cucco (CNR-IFC) e Prof.ssa Federica Gemignani (UNIPI)
Sede: Consiglio Nazionale delle Ricerche (CNR), Istituto di Fisiologia Clinica (IFC), Pisa
Descrizione: Obiettivo della tesi è indagare i meccanismi alla base dell’insorgenza e della progressione del linfoma diffuso a grandi cellule B (DLBCL), uno dei più aggressivi e frequenti tipi di linfoma non-Hodgkin. L’ attività sperimentale sarà focalizzata sulla caratterizzazione funzionale delle mutazioni puntiformi a carico di MYC, un gene spesso mutato in vari tipi di tumori. Tale attività riguarderà nello specifico la manipolazione di modelli in vitro (colture cellulari) nonché l’utilizzo di metodi di gene editing (e.g. SDM, CRISPR-Cas9) e di biologia molecolare. L’internato di tesi si inserisce in un progetto più ampio finanziato da AIRC (Project Code: 28911) che comprende indagini in ambito clinico utilizzando tecniche di NGS.
Referenze: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/40705113/, https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31844144/Contatti: Dott. Francesco Cucco (Questo indirizzo email è protetto dagli spambots. E' necessario abilitare JavaScript per vederlo., 050 3153090), Prof.ssa Federica Gemignani (Questo indirizzo email è protetto dagli spambots. E' necessario abilitare JavaScript per vederlo.)

Periodo: 1 ottobre 2025 - 30 giugno 2028
Corsi di Laurea interessati: Lauree Magistrali
Referente: Prof. Luca Paoli (Questo indirizzo email è protetto dagli spambots. E' necessario abilitare JavaScript per vederlo.). Tutor esterni Dr.ssa Zuzana Fačkovcová, Dr.ssa Anna Bérešová (Slovak Academy of Sciences).
Sede: Dipartimento di Biologia, Unità di Botanica, via Volta 6 (Pisa); Plant Science and Biodiversity Centre – Slovak Academy of Sciences (Bratislava, Slovacchia).
Descrizione: tesi disponibili nell’ambito del progetto VEGA “If it does not challenge you, it does not change you: legacy of substrate opportunities on microecology of symbiotic organisms”. Le attività di tesi di questo progetto mirano a comprendere come la geochimica dei substrati rocciosi influenzi la microecologia dei licheni, in particolare la composizione dei bionti principali e delle comunità microbiche associate. L’obiettivo è chiarire i meccanismi che regolano la diversità, le associazioni microbiche e la capacità di adattamento ai cambiamenti ambientali, anche attraverso esperimenti di traslocazione in aree caratterizzate da una diversa geochimica.
Attività di campo: Studio delle comunità licheniche epilitiche in Italia Centrale e nei Carpazi Occidentali.
Attività di laboratorio: tecniche di biologia molecolare, fra cui Sanger e high throughput sequencing.
Note: le attività di laboratorio si svolgono per un periodo di almeno tre mesi presso il Plant Science and Biodiversity Centre – Slovak Academy of Sciences (Bratislava, Slovacchia).

Periodo: SEMPRE DISPONIBILE
Corsi di Laurea interessati: WNF-LM, WTB-LM, WBO-LM
Referenti: prof. M. Gesi (Questo indirizzo email è protetto dagli spambots. E' necessario abilitare JavaScript per vederlo.), prof. A. Corti (Questo indirizzo email è protetto dagli spambots. E' necessario abilitare JavaScript per vederlo.)
Sede: Sezione di Anatomia Umana del Dipartimento di Ricerca Traslazionale e delle Nuove Tecnologie in Medicina e Chirurgia, via Roma 55, primo piano.
Descrizione: è disponibile un posto di internato di tesi Magistrale sul tema “effetti biologici di diverse terapie strumentali su cellule e tessuti dell’apparato muscolo-scheletrico”. L’attività sperimentale prevede manipolazione di colture cellulari, tecniche biochimiche e tecniche morfologiche di microscopia ottica ed elettronica. Sono requisiti essenziali: motivazione, capacità organizzativa e di lavorare in team, conoscenza di tecniche di laboratorio, curiosità e spirito di iniziativa.
Contatti: per informazioni contattare la dott.ssa L. Ryskalin (Questo indirizzo email è protetto dagli spambots. E' necessario abilitare JavaScript per vederlo.), la dott.ssa F. Fulceri (Questo indirizzo email è protetto dagli spambots. E' necessario abilitare JavaScript per vederlo.) o il prof. G. Morucci (Questo indirizzo email è protetto dagli spambots. E' necessario abilitare JavaScript per vederlo.)

Periodo: SEMPRE DISPONIBILE
Corsi di Laurea interessati: WTB-LM, WNF-LM, WBO-LM, WNC-LM, WBH-LM
Referente: Prof.ssa Giada Frenzilli, Prof. Daniele Campa e Prof.ssa Federica Gemignani.
Sede: Sezione di Biologia Applicata e Genetica del Dipartimento di Medicina Clinica e Sperimentale, via Volta 4, primo piano.
Descrizione: Disponibilità di un/due posto/i di internato per laurea Magistrale sul tema ““Very-long-term COVID-19: studio di marcatori molecolari del DNA 4 anni dopo l’infezione”. L’attività sperimentale prevederà l’allestimento e l’osservazione al microscopio di preparati di citogenetica volti a valutare la perdità di integrità del DNA, la presenza di basi ossidate e di aberrazioni cromosomiche in pazienti (in collaborazione con l’ospedale di Cisanello) a 4 anni dalla dimissione.
Per informazioni contattare la prof.ssa Frenzilli (Questo indirizzo email è protetto dagli spambots. E' necessario abilitare JavaScript per vederlo.).